Видання зареєстровані авторами шляхом самоархівування
Permanent URI for this communityhttps://devessuir.sumdu.edu.ua/handle/123456789/1
Browse
16 results
Search Results
Item Analysis of association between long non-coding RNA HOTAIR gene rs1899663 polymorphism and disease-free survival in kidney cancer patients(ТОВ «Поліграф плюс», 2020) Волкогон, Андрій Дмитрович; Volkohon, Andrii Dmytrovych; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Ataman, Oleksandr Vasylovych; Гарбузова, Єлізавета Антонівна; Harbuzova, Yelizaveta Antonivna; Колногуз, Альона Владиславівна; Kolnohuz, Alona VladyslavivnaМетою дослідження було вивчення можливої асоціації поліморфного сайту rs1899663 гена HOTAIR із виживаністю пацієнтів із раком нирки та його клініко-патологічними характеристиками. Методи. У роботі було використано венозна кров 101 пацієнта зі світлоклітинним нирково-клітинним раком (СКНКР) (42 жінки і 59 чоловіків). Генотипування за поліморфним локусом rs1899663 гена HOTAIR проводили за допомогою полімеразної ланцюгової реакції з наступним аналізом довжини рестрикційних фрагментів (PCR-RFLP). Статистичний аналіз виконували за допомогою пакету SPSS (версія 17.0). Тест Каплана-Мейера та регресія Кокса були використані для перевірки можливого зв’язку між поліморфізмом rs1899663 гена довгої некодуючої РНК HOTAIR та віком виникнення СКНКР. Значення Р < 0,05 вважали статистично значущими. Результати. Результати генотипування за rs1899663-поліморфізмом гена HOTAIR показали, що у хворих із СКНКР співвідношення гомозигот GG, гетерозигот GT і гомозигот ТТ складає 39,6 %, 52,5 % і 7,9 %, відповідно. Цей розподіл не відхилявся від очікуваного за законом Харді-Вайнберга (P = 0,143). Результати однофакторного дисперсійного аналізу показали, що rs1899663-локус гена HOTAIR не асоційований із розмір пухлини хворих із СКНКР, не пов’язаний із показниками індексу маси тіла, швидкістю осідання еритроцитів, вмістом глюкози, гемоглобіну, креатиніну та лейкоцитів у крові пацієнтів із СКНКР (Р > 0,05). Крім цього результати тесту Каплана-Мейере показали, що тривалість життя до моменту виникнення СКНКР не залежить від rs1899663-локусу (log rank Р = 0,739). Разом із цим результати аналізу методом регресії Кокса без та з поправкою на коваріати (стать, індекс маси тіла, наявність метастазів, звички курити та зловживання алкоголем) продемонстрували, що ризик виникнення СКНКР з віком не залежить від поліморфізму rs1899663 гена HOTAIR (Р > 0,05). Висновки. Виконане дослідження є першим щодо пошуку асоціації генетичного поліморфізму HOTAIR із виживаністю пацієнтів із раком нирки як в Україні, так і в усьому світі. Поліморфний сайт rs1899663 гена HOTAIR не асоційований із віком виникнення СКНКР в українській популяції. Крім цього, rs1899663-локус також не пов’язаний із розмірами пухлини та даними клініко-лабораторних досліджень у хворих із раком нирки.Item Long non-coding RNA MALAT1 gene polymorphism is associated with disease-free survival in bladder cancer patients(Івано-Франківський національний медичний університет, 2020) Волкогон, Андрій Дмитрович; Volkohon, Andrii Dmytrovych; Колногуз, Альона Владиславівна; Kolnohuz, Alona Vladyslavivna; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Ataman, Oleksandr VasylovychThe objective of the research was to study the possible association between MALAT1 gene rs3200401 polymorphism and the survival of patients with bladder cancer and clinicopathological characteristics in bladder cancer. Materials and Methods. The venous blood of 141 patients with transitional cell carcinoma of the urinary bladder was used for study. Genotyping of MALAT1 gene rs3200401 polymorphism was performed by real-time polymerase chain reaction using the 7500 Fast Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, USA) and Taq-Man Assays (TaqMan©SNP Assay C 3246069 10). Statistical analysis was performed using the SPSS software package (version 17.0). The Kaplan-Meier estimator and Cox regression were used to check the possible association between MALAT1 rs3200401-genotypes and the age of transitional cell carcinoma of the urinary bladder onset. P values < 0.05 were considered as statistically significant. Results. The obtained results revealed that hemoglobin concentration was lower in patients with transitional cell carcinoma of the urinary bladder and rs3200401TT-genotype than in patients with rs3200401CC-genotype (p = 0.024). Herewith, fasting glucose, creatinine concentration, and tumor width were significantly higher in patients with transitional cell carcinoma of the urinary bladder and rs3200401TT-genotype as compared to rs3200401CC-genotype carriers (p = 0.036, p = 0.039, p = 0.028, respectively). The results of survival analysis demonstrated that transitional cell carcinoma of the urinary bladder occurred much later in persons with rs3200401TT-genotype as compared to rs3200401C-allele carriers (log rank p = 0.016), and the risk of transitional cell carcinoma of the urinary bladder onset was lower in individuals with rs3200401TT than in major rs3200401C C-allele carriers (hazard ratio = 0.413; p = 0.047). Conclusions. Rs3200401 polymorphism of MALAT1 gene is associated with disease-free survival in Ukrainian patients with transitional cell carcinoma of the urinary bladder. Transitional cell carcinoma of the urinary bladder occurs later in persons with rs3200401TT-genotype than in individuals with rs3200401CC- and rs3200401CTgenotypes.Item The associason of vitamin d receptor gene (VDR) polymorphisms with high blood pressure in stroke patients of Ukrainian population(Aluna Publishing, 2020) Obukhova, Olha Anatoliivna; Обухова, Ольга Анатоліївна; Ataman, Oleksandr Vasylovych; Атаман, Олександр Васильович; Zavadska, Maryna Mykolaivna; Завадська, Марина Миколаївна; Piven, Svitlana Mykolaivna; Півень, Світлана Миколаївна; Levchenko, Zoia Mykhailivna; Левченко, Зоя МихайлівнаVenous blood of 170 patients with atherothrombotic ischemic stroke (AIS) and 124 healthy individuals (control group) was used for genotyping. Four polymorphisms (FokI, BsmI, ApaI, TaqI) of gene VDR were examined with PCR-RFLP methodology. Statistical analysis was performed by using SPSS-17.0 program. The correlation of genotypes of polymorphic variants of FokI, BsmI, ApaI and TaqI of the VDR gene with the development of ischemic atherothrombotic stroke in individuals with normal and high blood pressure was detected. Statistical analysis of the obtained data revealed that among carriers of genotypes F/F, b/b, a/a, a/A, and T/T patients with AI have statistically significantly higher incidence of hypertension than patients in the control group. It was found that persons with genotypes F/F, b/b, a/a, a/A, and T/T showed a statistically significant relationship between hypertension and the development of IAS. The application of logistic regression has made it possible to establish that the risk of IAS in people with normal blood pressure and genotype F/f is 3.2 times higher than in normotensive homozygotes for the F-allele.Item Analysis of ANRIL gene polymorphism rs4977574 association with kidney cancer development in Ukrainian population(Dnipro State Medical University, 2020) Волкогон, Андрій Дмитрович; Волкогон, Андрей Дмитриевич; Volkohon, Andrii Dmytrovych; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr VasylovychANRIL (Antisense Non-coding RNA in the INK4 Locus, also known as CDKN2B-AS1) – 3.8-kb long non-coding RNA transcribed from the antisense strand of INK4b-ARF-INK4a gene cluster. It is known that ANRIL overexpression is associated with development of oncological pathologies of different localization. In addition, there are a number of studies devoted to role of ANRIL genetic polymorphism in emergence and progression of tumors, including tumors of genitourinary system. The aim of the study was to check the possible association between ANRIL gene polymorphism rs4977574 and kidney cancer development in representatives of Ukrainian population. Whole venous blood of 101 patients with clear cell renal cell carcinoma (CCRCC) (42 women and 59 men) and 100 patients without oncology history (34 women and 66 men) was used in the study. DNA from blood white cells was extracted using GeneJET Whole Blood Genomic DNA Purification Mini Kit (Thermo Fisher Scientific, USA). Genotyping of rs4977574 ANRIL gene polymorphic locus was performed using realtime polymerase chain reaction (real-time PCR) method in the presence of TaqMan assay C_31720978_30. The mathematical data were processed using the SPSS software package (version 17.0). P values <0.05 were considered as statistically significant. It was found that difference in rs4977574-genotype distribution between patients with CCRCC and control persons was absent in general group (P=0.216). At the same time, the statistical analysis stratified by gender showed that both in female and male subjects rs4977574-genotypes frequency also did not differ significantly between comparison groups (P=0.526 and P=0.160, respectively). However, after adjusting for age, body mass index, and smoking habits statistically significant association between rs4977574 ANRIL gene polymorphism and risk of kidney cancer development was detected in male subjects under superdominant inheritance model (P=0.049). It was revealed that heterozygotes (AG-genotype) have 2.17-fold higher risk of CCRCC development (95% CI=1.005-4.695) compared to patients with AA- and GG-genotypes. In summary, this is the first report about ANRIL gene polymorphisms association with kidney cancer. Obtained results revealed that rs4977574 is related to kidney cancer risk only in Ukrainian men. Male individuals with AG-genotype have higher risk of CCRCC development compared to AA- and GG-genotypes carriers.Item The association analysis between HOTAIR rs920778 single nucleotide polymorphism and ischemic stroke development in Ukrainian population(Center for Molecular Medicine Cologne (CMMC) - University of Cologne, 2019) Моісеєнко, Каріна Ашотівна; Моисеенко, Карина Ашотовна; Moiseienko, Karina Ashotivna; Harbuzova, Yelizaveta Antonivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr Vasylovych; Гарбузова, Єлізавета Антонівна; Гарбузова, Елизавета АнтоновнаItem Зв'язок Aраl поліморфізму гена VDR з ішемічним інсультом з урахуванням дисліпопротеїнемії атерогенного характеру(Івано-Франківський національний медичний університет, 2019) Обухова, Ольга Анатоліївна; Обухова, Ольга Анатольевна; Obukhova, Olha Anatoliivna; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr VasylovychУ розвитку атеросклерозу вагоме значення належить запальним процесам у судинній стінці. Враховуючи імуномоделюючі властивості вітаміну D, його вплив на регуляцію атеросклеротичного процесу може мати важливе значення у розвитку серцево-судинних захворювань, включаючи клапанні кальцифікації, гіпертонію, ішемічний атеротромботичний інсульт.Item Розподіл алельних варіантів генів інгібіторів та активаторів ектопічної кальцифікації у пацієнтів із гострим коронарним синдромом.(Українське товариство генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова, 2017) Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Обухова, Ольга Анатоліївна; Обухова, Ольга Анатольевна; Obukhova, Olha Anatoliivna; Розуменко, Інна Олександрівна; Розуменко, Инна Александровна; Rozumenko, Inna Oleksandrivna; Дубовик, Євген Іванович; Дубовик, Евгений Иванович; Dubovyk, Yevhen Ivanovych; Олешко, Тетяна Миколаївна; Олешко, Татьяна Николаевна; Oleshko, Tetiana Mykolaivna; Гарбузова, Єлізавета Антонівна; Гарбузова, Елизавета Антоновна; Harbuzova, Yelizaveta Antonivna; Швачко, Д.В.; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr VasylovychАлельний поліморфізм генів активаторів і інгібіторів ектопічної кальцифікації є важливим фактором схильності до склеротичних захворювань артерій і їх ускладнення. Існує зв'язок між гострим коронарним синдромом і поліморфними варіантами генів TNAP (A69314G) і ANKH (T134967G).Item G-1639A but Not C1173T VKORC1 Gene Polymorphism Is Related to Ischemic Stroke and Its Various Risk Factors in Ukrainian Population(Hindawi Publishing Corporation, 2016) Дубовик, Євген Іванович; Дубовик, Евгений Иванович; Dubovyk, Yevhen Ivanovych; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr VasylovychVitamin K epoxide reductase complex subunit 1 (VKORC1) is integral 163-amino acid long transmembrane protein which mediates recycling of vitamin K 2,3-epoxide to vitamin K hydroquinone and it is necessary for activation of vitamin K-dependent proteins (VKDPs). Herein, the association between G-1639A (rs9923231) and C1173T (rs9934438) single-nucleotide polymorphisms (SNPs) of the VKORC1 gene and ischemic stroke (IS) was tested in Ukrainian population. Genotyping was performed in 170 IS patients and 124 control subjects (total 294 DNA samples) using PCR-RFLP (polymerase chain reaction with following restriction fragment length polymorphism analysis) method. Our data showed that G-1639A but not C1173T polymorphism was related to IS, regardless of adjustment for age, sex, body mass index, smoking status, and arterial hypertension. The risk for IS in -1639A allele carriers (OR = 2.138, ) was higher than in individuals with G/G genotype. Haplotype analysis demonstrated that -1639G/1173T and -1639A/1173C were related to increased risk for IS (OR = 3.813, and OR = 2.189, 𝑃 = 0.011, resp.), while -1639G/1173C was a protective factor for IS (OR = 0.548, ). Obtained results suggested that -1639A allele can be a possible genetic risk factor for IS in Ukrainian population.Item K121Q Polymorphism of the ENPP1 gene is related to acute coronary syndrome in Ukrainian patients with normal but not enhanced body mass index(Science Publications, 2015) Розуменко, Інна Олександрівна; Розуменко, Инна Александровна; Rozumenko, Inna Oleksandrivna; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Юрій Олександрович; Атаман, Юрий Александрович; Ataman, Yurii Oleksandrovych; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr VasylovychEctonucleotide Pyrophosphatase Phosphodiesterase 1 (ENPP1) is a class II membrane glycoprotein with two unrelated properties: It can hydrolyze extracellular nucleotides and downregulate insulin receptor signaling. The present study was carried out to investigate whether common single-nucleotide polymorphism K121Q (rs1044498) of the ENPP1 gene is associated with Acute Coronary Syndrome (ACS) in the representatives of Ukrainian population and to assess if the risk depends on gender and Body Mass Index (BMI). A total 228 DNA samples (118 ACS patients and 110 control subjects) were genotyped for the polymorphism by PCR and restriction fragment length polymorphism method. No associations between the K121Q polymorphisms and ACS were found neither on the whole nor taking into account the gender. However, in the persons with BMI <25 kg/m2 but not with overweight, genotypes with the minor allele (KQ + QQ) were significantly associated with ACS (OR 3.939, 95% CI 1.148-13.524, P = 0.029). Genotypes with minor allele can be a possible genetic risk factor for ACS in persons with BMI <25 kg/m2. It is likely that these genotypes affect ACS not by the traditional risk factors (overweight/obesity, insulin resistance and type 2 diabetes) but by direct or undirect influence on pathologic processes in the wall of the coronary vessels (atherosclerosis and arterial calcification).Item Association of allelic polymorphisms of the Matrix Gla-protein system genes with acute coronary syndrome in the Ukrainian population(Institute of Molecular Biology and Genetics, NAS of Ukraine, 2015) Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Stroy, D.A.; Dosenko, V.Ye.; Обухова, Ольга Анатоліївна; Обухова, Ольга Анатольевна; Obukhova, Olha Anatoliivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr VasylovychКальцифікація судинної стінки є несприятливим прогностичним фактором фатальних наслідків гострого коронарного синдрому (ГКС). Важливим захисним фактором судин від ектопічної кальцифікації є система матриксного Gla-про теїну, яка включає MGP, VDR, VKOR, GGCX, BMP-2. Поліморфізм генів, які кодують структуру даних білків, визначає їх активність і можливо впливає на інтенсивність кальцификации і наслідки ГКС. Ме та. Проаналізувати зв'я зок між ГКС і поліморфними варіантами генів: MGP (rs1800802, rs1800801, rs4236), VDR (rs2228570, rs1544410, rs7975232, rs731236), GGCX (rs699664), VKORC1 (rs2359612), BMP-2 (rs 2273073). Методи. Для генотипування була використана венозна кров 118 пацієнтів з ГКС і 234 здорових індивідуумів (контрольна група). Визначення поліморфізму генів системи матриксного Gla-протеїну проводили за допомогою методу полімеразної ланцюгової реакції з наступним аналізом довжини рестрикційних фрагментів при виявленні їх шляхом електрофорезу в агарозному гелі. Результати. Ризик ГКС у носіїв мінорного аллеля A/A (rs1800801) в 2,8 рази; G/G (rs1544410) в 2,1 рази; A (rs699664) і C (rs2359612) в 2 рази вище, ніж у носіїв основного аллеля. Кращою класифікаційної моделлю є двокомпонентна модель, яка включає в себе поліморфні варіанти (rs1800801, rs4236) гена MGP (прогностична здатність 63 % за методом МDR і 68 % за методом Random forest). Збіг в однієї особи подібних за спрямованістю варіантів генотипів за зазначеними по ліморфізмами асоціюється зі збільшенням ризику ГКС: у гетерозигот за обома поліморфізмами він підвищується у 2,1 раза, а в гомозигот за мінорними алелями – у 6,3 ра за. Висновки. Існує зв’язок між ОКС і деякими поліморфни ми варіантами генів системи матриксного Gla-протеї ну: MGP (rs1800801), VDR (rs1544410), GGCX (rs699664), VKORC1 (rs2359612). Це свідчить про великий ризик ускладнень у пацієнтів з ГКС, які мали генотипи A/A (rs1800801), G/G (rs1544410), A/A (rs 699664) and C/C (rs2359612).