Видання зареєстровані авторами шляхом самоархівування
Permanent URI for this communityhttps://devessuir.sumdu.edu.ua/handle/123456789/1
Browse
6 results
Search Results
Item Association study between BGLAP RS1800247-polymorphic variant and type 2 diabetes mellitus development among hypertensive and non-hypertensive Ukrainians(Запорізький державний медико-фармацевтичний університет, 2021) Чумаченко, Ярослав Дмитрович; Chumachenko, Yaroslav Dmytrovych; Кириченко, Микола Олександрович; Kyrychenko, Mykola Oleksandrovych; Ramazanova, D.M.; Smiianova, M.V.; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Ataman, Oleksandr VasylovychРизик виникнення цукрового діабету 2 типу (ЦД2) залежить від генетичної схильності. За сучасними даними, кісткова тканина підвищує експресію гена інсуліну β-клітинами підшлункової залози, а також збільшує чутливість адипоцитів, міоцитів і гепатоцитів до інсуліну шляхом продукування декарбоксильованого остеокальцину (unOCN). Мета роботи – проаналізувати зв’язок між rs1800247-однонуклеотидним поліморфізмом і виникненням ЦД2 залежно від наявності артеріальної гіпертензії (АГ), а також зв’язок між rs1800247 і систолічним, діастолічним, пульсовим, середнім кров’яним тиском в осіб із ЦД2. Матеріали та методи. У дослідження залучили 153 пацієнтів з діагностованим ЦД2 і 311 осіб без будь-яких порушень вуглеводного обміну. Генотипування осіб за rs1800247-поліморфізмом гена BGLAP виконали за допомогою полімеразної ланцюгової реакції з аналізом довжини рестрикційних фрагментів (PCR-RFLP). Для оцінювання зв’язку між генотипами за rs1800247-поліморфізмом гена BGLAP і розвитком ЦД2 застосували логістичну регресію (враховуючи незалежну змінну «генотип × АГ») у межах домінантної, рецесивної, наддомінантної та адитивної моделей спадкування. Для дослідження впливу мінорного С-алеля на рівень артеріального тиску використали метод лінійної регресії. Показники ліпідного обміну в пацієнтів із ЦД2 залежно від rs1800247-генотипу порівнювали за допомогою однофакторного дисперсійного аналізу та тесту Бонферроні. Усі розрахунки виконали, використовуючи програму для статистичного опрацювання даних SPSS 22.0. Значення p ˂ 0,05 свідчило про статистичну значущість результатів. Результати. Встановили відсутність зв’язку між rs1800247-однонуклеотидним поліморфізмом і розвитком ЦД2 і в осіб з АГ, і в обстежених із нормальним артеріальним тиском (pa int b > 0,05). Вплив генотипів за rs1800247-поліморфізмом на рівні систолічного, діастолічного, пульсового та середнього тиску в осіб із ЦД2 відсутній (p > 0,05). Однак носії СС-генотипу у групі хворих на ЦД2 без АГ мають істотно нижчий рівень загального холестеролу (p = 0,012), ЛПНЩ (p = 0,04) і вищий рівень ЛПВЩ (p = 0,015) порівняно з ТТ-генотипом. Висновки. Виявили, що носії СС-генотипу мають сприятливіші показники ліпідного метаболізму серед українців із ЦД2 та без АГ. Але відсутній зв’язок між rs1800247-однонуклеотидним поліморфізмом, виникненням ЦД2 і показниками артеріального тиску.Item LncRNA SRA gene polymorphisms and risk of gynecological pathology development among Ukrainian women with proliferative type of benign breast disease without atypia(Запорізький державний медико-фармацевтичний університет, 2021) Лукавенко, Іван Михайлович; Lukavenko, Ivan Mykhailovych; Колногуз, Альона Владиславівна; Kolnohuz, Alona Vladyslavivna; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Ataman, Oleksandr Vasylovychлози (РМЗ). РМЗ – найбільш поширене онкологічне захворювання у світі, тому важливо знайти нові біомаркери та мішені для ранньої діагностики, лікування, визначення прогнозу та виживання. Довга некодувальна РНК SRA може відіграти цю роль, а отже необхідні дальші дослідження її впливу на патогенез передракових уражень. Мета роботи – проаналізувати зв’язок між rs801460 та rs10463297 поліморфізмами та виникненням гінекологічної патології серед українських жінок із проліферативним типом доброякісної дисплазії молочної залози без атипії. Матеріали та методи. У дослідження ввійшли 115 пацієнток із проліферативним типом доброякісної дисплазії молочної залози без атипії: 55 – із гінекологічною патологією та 60 – без неї. Полімеразна ланцюгова реакція з аналізом довжини рестрикційних фрагментів (PCR-RFLP) використана для генотипування поліморфізмів. Для фарбування зрізів застосовували гематоксилін, еозин, толуїдиновий синій і пікрофуксин за ван Гізоном. Статистичний аналіз здійснили з використанням програми для статистичного опрацювання даних SPSS 25.0. Результати. Встановили суттєві відмінності в частоті алелей rs10463297-поліморфізму (р = 0,032), але не rs801460 (р > 0,05) у групах із гінекологічною патологією та без неї. Водночас розподіл генотипів обох поліморфізмів статистично не відрізнявся (р > 0,05). Суттєвий зв’язок виявили між SRA1 rs10463297-поліморфізмом та виникненням гінекологічної патології в домінантній (рa = 0,023; ORa = 2,638, 95 % CI = 1,145–6,076) та адитивній (рa = 0,034; ORa = 2,489, 95 % CI = 1,069–5,794) моделях. Не встановлено зв’язку між SRA1 rs801460-поліморфізмом та розвитком цієї патології (р > 0,05). Висновки. Виявлено, що носії SRA1 rs10463297 TT-генотипу мають у 2,6 раза вищий ризик розвитку гінекологічної патології, ніж носії С-алеля, та у 2,48 раза – ніж ТС-гетерозиготи.Item Analysis of association between long non-coding RNA HOTAIR gene rs1899663 polymorphism and disease-free survival in kidney cancer patients(ТОВ «Поліграф плюс», 2020) Волкогон, Андрій Дмитрович; Volkohon, Andrii Dmytrovych; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Ataman, Oleksandr Vasylovych; Гарбузова, Єлізавета Антонівна; Harbuzova, Yelizaveta Antonivna; Колногуз, Альона Владиславівна; Kolnohuz, Alona VladyslavivnaМетою дослідження було вивчення можливої асоціації поліморфного сайту rs1899663 гена HOTAIR із виживаністю пацієнтів із раком нирки та його клініко-патологічними характеристиками. Методи. У роботі було використано венозна кров 101 пацієнта зі світлоклітинним нирково-клітинним раком (СКНКР) (42 жінки і 59 чоловіків). Генотипування за поліморфним локусом rs1899663 гена HOTAIR проводили за допомогою полімеразної ланцюгової реакції з наступним аналізом довжини рестрикційних фрагментів (PCR-RFLP). Статистичний аналіз виконували за допомогою пакету SPSS (версія 17.0). Тест Каплана-Мейера та регресія Кокса були використані для перевірки можливого зв’язку між поліморфізмом rs1899663 гена довгої некодуючої РНК HOTAIR та віком виникнення СКНКР. Значення Р < 0,05 вважали статистично значущими. Результати. Результати генотипування за rs1899663-поліморфізмом гена HOTAIR показали, що у хворих із СКНКР співвідношення гомозигот GG, гетерозигот GT і гомозигот ТТ складає 39,6 %, 52,5 % і 7,9 %, відповідно. Цей розподіл не відхилявся від очікуваного за законом Харді-Вайнберга (P = 0,143). Результати однофакторного дисперсійного аналізу показали, що rs1899663-локус гена HOTAIR не асоційований із розмір пухлини хворих із СКНКР, не пов’язаний із показниками індексу маси тіла, швидкістю осідання еритроцитів, вмістом глюкози, гемоглобіну, креатиніну та лейкоцитів у крові пацієнтів із СКНКР (Р > 0,05). Крім цього результати тесту Каплана-Мейере показали, що тривалість життя до моменту виникнення СКНКР не залежить від rs1899663-локусу (log rank Р = 0,739). Разом із цим результати аналізу методом регресії Кокса без та з поправкою на коваріати (стать, індекс маси тіла, наявність метастазів, звички курити та зловживання алкоголем) продемонстрували, що ризик виникнення СКНКР з віком не залежить від поліморфізму rs1899663 гена HOTAIR (Р > 0,05). Висновки. Виконане дослідження є першим щодо пошуку асоціації генетичного поліморфізму HOTAIR із виживаністю пацієнтів із раком нирки як в Україні, так і в усьому світі. Поліморфний сайт rs1899663 гена HOTAIR не асоційований із віком виникнення СКНКР в українській популяції. Крім цього, rs1899663-локус також не пов’язаний із розмірами пухлини та даними клініко-лабораторних досліджень у хворих із раком нирки.Item Long non-coding RNA MALAT1 gene polymorphism is associated with disease-free survival in bladder cancer patients(Івано-Франківський національний медичний університет, 2020) Волкогон, Андрій Дмитрович; Volkohon, Andrii Dmytrovych; Колногуз, Альона Владиславівна; Kolnohuz, Alona Vladyslavivna; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Ataman, Oleksandr VasylovychThe objective of the research was to study the possible association between MALAT1 gene rs3200401 polymorphism and the survival of patients with bladder cancer and clinicopathological characteristics in bladder cancer. Materials and Methods. The venous blood of 141 patients with transitional cell carcinoma of the urinary bladder was used for study. Genotyping of MALAT1 gene rs3200401 polymorphism was performed by real-time polymerase chain reaction using the 7500 Fast Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, USA) and Taq-Man Assays (TaqMan©SNP Assay C 3246069 10). Statistical analysis was performed using the SPSS software package (version 17.0). The Kaplan-Meier estimator and Cox regression were used to check the possible association between MALAT1 rs3200401-genotypes and the age of transitional cell carcinoma of the urinary bladder onset. P values < 0.05 were considered as statistically significant. Results. The obtained results revealed that hemoglobin concentration was lower in patients with transitional cell carcinoma of the urinary bladder and rs3200401TT-genotype than in patients with rs3200401CC-genotype (p = 0.024). Herewith, fasting glucose, creatinine concentration, and tumor width were significantly higher in patients with transitional cell carcinoma of the urinary bladder and rs3200401TT-genotype as compared to rs3200401CC-genotype carriers (p = 0.036, p = 0.039, p = 0.028, respectively). The results of survival analysis demonstrated that transitional cell carcinoma of the urinary bladder occurred much later in persons with rs3200401TT-genotype as compared to rs3200401C-allele carriers (log rank p = 0.016), and the risk of transitional cell carcinoma of the urinary bladder onset was lower in individuals with rs3200401TT than in major rs3200401C C-allele carriers (hazard ratio = 0.413; p = 0.047). Conclusions. Rs3200401 polymorphism of MALAT1 gene is associated with disease-free survival in Ukrainian patients with transitional cell carcinoma of the urinary bladder. Transitional cell carcinoma of the urinary bladder occurs later in persons with rs3200401TT-genotype than in individuals with rs3200401CC- and rs3200401CTgenotypes.Item The Study of Association Between BGLAP HindIII-Polymorphic Variant And Type 2 Diabetes Mellitus Development Among Ukrainians With Arterial Hypertension(Elsevier, 2021) Чумаченко, Ярослав Дмитрович; Чумаченко, Ярослав Дмитриевич; Chumachenko, Yaroslav Dmytrovych; Колногуз, Альона Владиславівна; Колногуз, Алена Владиславовна; Kolnohuz, Alona Vladyslavivna; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr VasylovychBackground: Nowadays, the attention of scientists is focused on the systemic energy metabolism regulation by skeleton. Bone tissue affects the glucose turnover through the production of undercarboxylated osteocalcin (ucOCN), which in turn stimulates insulin expression and secretion as well as increases sensitivity of adipocytes, muscle cells and hepatocytes for this hormone. Current evidence showed an inverse association between serum OCN concentration and adverse metabolic outcomes, assuming the crucial role of OCN in type 2 diabetes mellitus (T2DM) pathogenesis. Objective: To analyze the link between OCN gene (BGLAP) HindIII-polymorphism and T2DM occurrence among Ukrainians with arterial hypertension (AH). Methods: The study included 153 patients with T2DM (mean age ± SD 64.67±8.2 years) and 311 relatively healthy individuals (mean age 65.65±12.58 years). Polymerase chain reaction- restriction fragments length polymorphism analysis (PCR-RFLP) was performed for genotyping. Logistic regression with interaction term “genotype × AH” was used for the association analysis under four models of inheritance. Bonferroni correction was applied for accurate results. P ˂ 0.05 was considered as significant. Results: There was no statistically significant association between BGLAP HindIII-polymorphic variant under dominant, recessive, overdominant and additive models of inheritance (Pab N 0.05; Paint b N 0.05). Conclusion: No association was found between BGLAP HindIIIpolymorphic variant and T2DM development among Ukrainians with AH. Further studies are necessary to confirm the results.Item Analysis of ANRIL gene polymorphism rs4977574 association with kidney cancer development in Ukrainian population(Dnipro State Medical University, 2020) Волкогон, Андрій Дмитрович; Волкогон, Андрей Дмитриевич; Volkohon, Andrii Dmytrovych; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr VasylovychANRIL (Antisense Non-coding RNA in the INK4 Locus, also known as CDKN2B-AS1) – 3.8-kb long non-coding RNA transcribed from the antisense strand of INK4b-ARF-INK4a gene cluster. It is known that ANRIL overexpression is associated with development of oncological pathologies of different localization. In addition, there are a number of studies devoted to role of ANRIL genetic polymorphism in emergence and progression of tumors, including tumors of genitourinary system. The aim of the study was to check the possible association between ANRIL gene polymorphism rs4977574 and kidney cancer development in representatives of Ukrainian population. Whole venous blood of 101 patients with clear cell renal cell carcinoma (CCRCC) (42 women and 59 men) and 100 patients without oncology history (34 women and 66 men) was used in the study. DNA from blood white cells was extracted using GeneJET Whole Blood Genomic DNA Purification Mini Kit (Thermo Fisher Scientific, USA). Genotyping of rs4977574 ANRIL gene polymorphic locus was performed using realtime polymerase chain reaction (real-time PCR) method in the presence of TaqMan assay C_31720978_30. The mathematical data were processed using the SPSS software package (version 17.0). P values <0.05 were considered as statistically significant. It was found that difference in rs4977574-genotype distribution between patients with CCRCC and control persons was absent in general group (P=0.216). At the same time, the statistical analysis stratified by gender showed that both in female and male subjects rs4977574-genotypes frequency also did not differ significantly between comparison groups (P=0.526 and P=0.160, respectively). However, after adjusting for age, body mass index, and smoking habits statistically significant association between rs4977574 ANRIL gene polymorphism and risk of kidney cancer development was detected in male subjects under superdominant inheritance model (P=0.049). It was revealed that heterozygotes (AG-genotype) have 2.17-fold higher risk of CCRCC development (95% CI=1.005-4.695) compared to patients with AA- and GG-genotypes. In summary, this is the first report about ANRIL gene polymorphisms association with kidney cancer. Obtained results revealed that rs4977574 is related to kidney cancer risk only in Ukrainian men. Male individuals with AG-genotype have higher risk of CCRCC development compared to AA- and GG-genotypes carriers.