Видання зареєстровані авторами шляхом самоархівування

Permanent URI for this communityhttps://devessuir.sumdu.edu.ua/handle/123456789/1

Browse

Search Results

Now showing 1 - 10 of 13
  • Item
    Analysis of ANRIL gene polymorphism rs4977574 association with kidney cancer development in Ukrainian population
    (Dnipro State Medical University, 2020) Волкогон, Андрій Дмитрович; Волкогон, Андрей Дмитриевич; Volkohon, Andrii Dmytrovych; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr Vasylovych
    ANRIL (Antisense Non-coding RNA in the INK4 Locus, also known as CDKN2B-AS1) – 3.8-kb long non-coding RNA transcribed from the antisense strand of INK4b-ARF-INK4a gene cluster. It is known that ANRIL overexpression is associated with development of oncological pathologies of different localization. In addition, there are a number of studies devoted to role of ANRIL genetic polymorphism in emergence and progression of tumors, including tumors of genitourinary system. The aim of the study was to check the possible association between ANRIL gene polymorphism rs4977574 and kidney cancer development in representatives of Ukrainian population. Whole venous blood of 101 patients with clear cell renal cell carcinoma (CCRCC) (42 women and 59 men) and 100 patients without oncology history (34 women and 66 men) was used in the study. DNA from blood white cells was extracted using GeneJET Whole Blood Genomic DNA Purification Mini Kit (Thermo Fisher Scientific, USA). Genotyping of rs4977574 ANRIL gene polymorphic locus was performed using realtime polymerase chain reaction (real-time PCR) method in the presence of TaqMan assay C_31720978_30. The mathematical data were processed using the SPSS software package (version 17.0). P values <0.05 were considered as statistically significant. It was found that difference in rs4977574-genotype distribution between patients with CCRCC and control persons was absent in general group (P=0.216). At the same time, the statistical analysis stratified by gender showed that both in female and male subjects rs4977574-genotypes frequency also did not differ significantly between comparison groups (P=0.526 and P=0.160, respectively). However, after adjusting for age, body mass index, and smoking habits statistically significant association between rs4977574 ANRIL gene polymorphism and risk of kidney cancer development was detected in male subjects under superdominant inheritance model (P=0.049). It was revealed that heterozygotes (AG-genotype) have 2.17-fold higher risk of CCRCC development (95% CI=1.005-4.695) compared to patients with AA- and GG-genotypes. In summary, this is the first report about ANRIL gene polymorphisms association with kidney cancer. Obtained results revealed that rs4977574 is related to kidney cancer risk only in Ukrainian men. Male individuals with AG-genotype have higher risk of CCRCC development compared to AA- and GG-genotypes carriers.
  • Item
    The association analysis between HOTAIR rs920778 single nucleotide polymorphism and ischemic stroke development in Ukrainian population
    (Center for Molecular Medicine Cologne (CMMC) - University of Cologne, 2019) Моісеєнко, Каріна Ашотівна; Моисеенко, Карина Ашотовна; Moiseienko, Karina Ashotivna; Harbuzova, Yelizaveta Antonivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr Vasylovych; Гарбузова, Єлізавета Антонівна; Гарбузова, Елизавета Антоновна
  • Item
    Зв'язок Aраl поліморфізму гена VDR з ішемічним інсультом з урахуванням дисліпопротеїнемії атерогенного характеру
    (Івано-Франківський національний медичний університет, 2019) Обухова, Ольга Анатоліївна; Обухова, Ольга Анатольевна; Obukhova, Olha Anatoliivna; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr Vasylovych
    У розвитку атеросклерозу вагоме значення належить запальним процесам у судинній стінці. Враховуючи імуномоделюючі властивості вітаміну D, його вплив на регуляцію атеросклеротичного процесу може мати важливе значення у розвитку серцево-судинних захворювань, включаючи клапанні кальцифікації, гіпертонію, ішемічний атеротромботичний інсульт.
  • Item
    Розподіл алельних варіантів генів інгібіторів та активаторів ектопічної кальцифікації у пацієнтів із гострим коронарним синдромом.
    (Українське товариство генетиків і селекціонерів ім. М.І. Вавилова, 2017) Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Обухова, Ольга Анатоліївна; Обухова, Ольга Анатольевна; Obukhova, Olha Anatoliivna; Розуменко, Інна Олександрівна; Розуменко, Инна Александровна; Rozumenko, Inna Oleksandrivna; Дубовик, Євген Іванович; Дубовик, Евгений Иванович; Dubovyk, Yevhen Ivanovych; Олешко, Тетяна Миколаївна; Олешко, Татьяна Николаевна; Oleshko, Tetiana Mykolaivna; Гарбузова, Єлізавета Антонівна; Гарбузова, Елизавета Антоновна; Harbuzova, Yelizaveta Antonivna; Швачко, Д.В.; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr Vasylovych
    Алельний поліморфізм генів активаторів і інгібіторів ектопічної кальцифікації є важливим фактором схильності до склеротичних захворювань артерій і їх ускладнення. Існує зв'язок між гострим коронарним синдромом і поліморфними варіантами генів TNAP (A69314G) і ANKH (T134967G).
  • Item
    G-1639A but Not C1173T VKORC1 Gene Polymorphism Is Related to Ischemic Stroke and Its Various Risk Factors in Ukrainian Population
    (Hindawi Publishing Corporation, 2016) Дубовик, Євген Іванович; Дубовик, Евгений Иванович; Dubovyk, Yevhen Ivanovych; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr Vasylovych
    Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1 (VKORC1) is integral 163-amino acid long transmembrane protein which mediates recycling of vitamin K 2,3-epoxide to vitamin K hydroquinone and it is necessary for activation of vitamin K-dependent proteins (VKDPs). Herein, the association between G-1639A (rs9923231) and C1173T (rs9934438) single-nucleotide polymorphisms (SNPs) of the VKORC1 gene and ischemic stroke (IS) was tested in Ukrainian population. Genotyping was performed in 170 IS patients and 124 control subjects (total 294 DNA samples) using PCR-RFLP (polymerase chain reaction with following restriction fragment length polymorphism analysis) method. Our data showed that G-1639A but not C1173T polymorphism was related to IS, regardless of adjustment for age, sex, body mass index, smoking status, and arterial hypertension. The risk for IS in -1639A allele carriers (OR = 2.138, ) was higher than in individuals with G/G genotype. Haplotype analysis demonstrated that -1639G/1173T and -1639A/1173C were related to increased risk for IS (OR = 3.813, and OR = 2.189, 𝑃 = 0.011, resp.), while -1639G/1173C was a protective factor for IS (OR = 0.548, ). Obtained results suggested that -1639A allele can be a possible genetic risk factor for IS in Ukrainian population.
  • Item
    K121Q Polymorphism of the ENPP1 gene is related to acute coronary syndrome in Ukrainian patients with normal but not enhanced body mass index
    (Science Publications, 2015) Розуменко, Інна Олександрівна; Розуменко, Инна Александровна; Rozumenko, Inna Oleksandrivna; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Атаман, Юрій Олександрович; Атаман, Юрий Александрович; Ataman, Yurii Oleksandrovych; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr Vasylovych
    Ectonucleotide Pyrophosphatase Phosphodiesterase 1 (ENPP1) is a class II membrane glycoprotein with two unrelated properties: It can hydrolyze extracellular nucleotides and downregulate insulin receptor signaling. The present study was carried out to investigate whether common single-nucleotide polymorphism K121Q (rs1044498) of the ENPP1 gene is associated with Acute Coronary Syndrome (ACS) in the representatives of Ukrainian population and to assess if the risk depends on gender and Body Mass Index (BMI). A total 228 DNA samples (118 ACS patients and 110 control subjects) were genotyped for the polymorphism by PCR and restriction fragment length polymorphism method. No associations between the K121Q polymorphisms and ACS were found neither on the whole nor taking into account the gender. However, in the persons with BMI <25 kg/m2 but not with overweight, genotypes with the minor allele (KQ + QQ) were significantly associated with ACS (OR 3.939, 95% CI 1.148-13.524, P = 0.029). Genotypes with minor allele can be a possible genetic risk factor for ACS in persons with BMI <25 kg/m2. It is likely that these genotypes affect ACS not by the traditional risk factors (overweight/obesity, insulin resistance and type 2 diabetes) but by direct or undirect influence on pathologic processes in the wall of the coronary vessels (atherosclerosis and arterial calcification).
  • Item
    Association of allelic polymorphisms of the Matrix Gla-protein system genes with acute coronary syndrome in the Ukrainian population
    (Institute of Molecular Biology and Genetics, NAS of Ukraine, 2015) Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Stroy, D.A.; Dosenko, V.Ye.; Обухова, Ольга Анатоліївна; Обухова, Ольга Анатольевна; Obukhova, Olha Anatoliivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr Vasylovych
    Кальцифікація судинної стінки є несприятливим прогностичним фактором фатальних наслідків гострого коронарного синдрому (ГКС). Важливим захисним фактором судин від ектопічної кальцифікації є система матриксного Gla-про теїну, яка включає MGP, VDR, VKOR, GGCX, BMP-2. Поліморфізм генів, які кодують структуру даних білків, визначає їх активність і можливо впливає на інтенсивність кальцификации і наслідки ГКС. Ме та. Проаналізувати зв'я зок між ГКС і поліморфними варіантами генів: MGP (rs1800802, rs1800801, rs4236), VDR (rs2228570, rs1544410, rs7975232, rs731236), GGCX (rs699664), VKORC1 (rs2359612), BMP-2 (rs 2273073). Методи. Для генотипування була використана венозна кров 118 пацієнтів з ГКС і 234 здорових індивідуумів (контрольна група). Визначення поліморфізму генів системи матриксного Gla-протеїну проводили за допомогою методу полімеразної ланцюгової реакції з наступним аналізом довжини рестрикційних фрагментів при виявленні їх шляхом електрофорезу в агарозному гелі. Результати. Ризик ГКС у носіїв мінорного аллеля A/A (rs1800801) в 2,8 рази; G/G (rs1544410) в 2,1 рази; A (rs699664) і C (rs2359612) в 2 рази вище, ніж у носіїв основного аллеля. Кращою класифікаційної моделлю є двокомпонентна модель, яка включає в себе поліморфні варіанти (rs1800801, rs4236) гена MGP (прогностична здатність 63 % за методом МDR і 68 % за методом Random forest). Збіг в однієї особи подібних за спрямованістю варіантів генотипів за зазначеними по ліморфізмами асоціюється зі збільшенням ризику ГКС: у гетерозигот за обома поліморфізмами він підвищується у 2,1 раза, а в гомозигот за мінорними алелями – у 6,3 ра за. Висновки. Існує зв’язок між ОКС і деякими поліморфни ми варіантами генів системи матриксного Gla-протеї ну: MGP (rs1800801), VDR (rs1544410), GGCX (rs699664), VKORC1 (rs2359612). Це свідчить про великий ризик ускладнень у пацієнтів з ГКС, які мали генотипи A/A (rs1800801), G/G (rs1544410), A/A (rs 699664) and C/C (rs2359612).
  • Item
    Асоціація поліморфізму генів системи матриксного Gla-протеїну з розвитком ішемічного атеротромботичного інсульту
    (Інститут фізіології ім. А.А. Богомольця Національної академії наук України, 2015) Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Строй, Д.А.; Досенко, В.Є.; Дубовик, Євген Іванович; Дубовик, Евгений Иванович; Dubovyk, Yevhen Ivanovych; Бороденко, Анастасія Олександрівна; Бороденко, Анастасия Александровна; Borodenko, Anastasiia Oleksandrivna; Шимко, Карiна Ашотiвна; Шимко, Карина Ашотовна; Shymko, Karina Ashotivna; Обухова, Ольга Анатоліївна; Обухова, Ольга Анатольевна; Obukhova, Olha Anatoliivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr Vasylovych
    Наведено результати визначення 10 поліморфізмів генів системи матриксного Gla-протеїну (ген MGP – T-138→С (rs1800802), G-7→A (rs1800801), Thr83→Ala (rs4236); ген VDR – FokI (rs2228570), BsmI (rs1544410), ApaI (rs7975232), TaqI (rs731236), ген GGCX – Arg325→Gln (rs699664), ген VKORС1 – T2255→C (rs2359612), ген BMP-2 – Ser37→Ala (rs2273073)) у 170 хворих з ішемічним атеротром- ботичним інсультом (ІАТІ) і 124 здорових індивідуумів (контрольна група). Встановлено, що існує зв’язок між ІАТІ і поліморфними варіантами генів MGP (G-7→A) та VKORC1 (Т2255→С). Ризик розвитку ІАТІ у носіїв мінорного алеля A/A (G-7→A-поліморфізм) у 2,6 вищий, ніж у носіїв основного алеля (G/A+G/G), а у осіб з генотипом С/С (Т2255→С-поліморфізм) у 2,2 раза більший, ніж у гомозигот за основним алелем. Збіг у пацієнтів генотипів T/C і G/G, C/C і G/A, а також генотипу A/A (G-7→A- поліморфізм) із будь-яким з генотипів за Т2255→С-поліморфізмом збільшує ризик розвитку ІАТІ.
  • Item
    Аналіз зв’язку поліморфізму rs2592551 гена γ-глутамілкарбоксилази з розвитком ішемічного атеротромботичного інсульту
    (Інститут фізіології ім. А.А. Богомольця Національної академії наук України, 2017) Дубовик, Євген Іванович; Дубовик, Евгений Иванович; Dubovyk, Yevhen Ivanovych; Гарбузова, Вікторія Юріївна; Гарбузова, Виктория Юрьевна; Harbuzova, Viktoriia Yuriivna; Обухова, Ольга Анатоліївна; Обухова, Ольга Анатольевна; Obukhova, Olha Anatoliivna; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr Vasylovych
    Представлені результати визначення поліморфізму rs2592551 гена γ-глутамілкарбоксилази у 170 хворих на ішемічний атеротромботичний інсульт та 124 осіб без гострої цереброваскулярної патології (контрольна група). Встановлено, що існує асоціація між цих захворюванням і наведеним поліморфним варіантом. Ризик розвитку інсульту в осіб з генотипом Т/Т був вищий, ніж у носіїв основного С-алеля (відношення шансів (OR) = 3,117; 95% довірчий інтервал (CI) = 1,016-9,566; Р = 0,047). Після поділу пацієнтів груп порівняння на підгрупи, сформовані за наявністю деяких факторів ризику атеросклерозу, подібний зв’язок був виявлений в осіб жіночої статі та без звички куріння. Водночас гетерозиготний генотип (С/Т) у жінок мав вірогідний протективний ефект щодо розвитку ішемічного інсульту, якщо порівнювати з генотипами С/С і Т/Т (OR = 0,460; 95% CI = 0,213-0,994; Р = 0,048). Достовірність цих результатів зберігалася навіть після поправки на вік, індекс маси тіла, куріння та артеріальну гіпертензію
  • Item
    Оцінка зв'язку BsmI поліморфізму гена VDR з антропометричними показниками у хворих з ішемічним інсультом
    (Сумський державний університет, 2016) Обухова, Ольга Анатоліївна; Обухова, Ольга Анатольевна; Obukhova, Olha Anatoliivna; Фоменко, І.Г.; Лопатка, О.Ю.; Атаман, Олександр Васильович; Атаман, Александр Васильевич; Ataman, Oleksandr Vasylovych
    Актуальність. Інсульт є однією з основних причин смерті в розвинених країнах і тим більше в Україні. Поширеність інсульту і тягар інвалідності, як очікується, зростуть в майбутньому, оскільки відбувається процес старіння населення. Крім віку до чинників ризику розвитку інсульту відносяться артеріальна гіпертензія, паління, цукровий діабет, гіпертрофія лівого шлуночка і фібриляція передсердь. Ожиріння, як правило, передує розвитку артеріальної гіпертензії, цукрового діабету та їх ускладнень, що грає важливу непряму роль в епідеміології ішемічного інсульту. Метою нашої роботи було провести аналіз зв’язку BsmI поліморфізму гена рецептора вітаміну D (VDR) у двох груп, утворених за показником ІМТ (<25 кг/м2 і ≥25 кг/м2) хворих на ішемічний атеротромботичний інсульт (ІАІ).