The present conception of neonatal microbiome formation

Abstract

Період новонародженості є критичним в процесі розвитку мікробіомута шлунково-кишкового тракту у немовлят загалом. Тобто, мікробіом регулює не тільки процеси, які пов’язані з основними функціями шлунково-кишкового тракту, а має зв’язок з вмістом вітамінів, деяких мікронутрієнтів, впливає на розвиток нервової та ендокринної системи новонароджених. Постнатальна мікробна колонізація є важливою ранньою подією в мутуалізмі господар-мікроб. Дуже добре, що материнські мікробіом та імунітет готують новонародженого малюка до його майбутніх проблем. Хоча передчасні пологи вже багато років пов’язані з мікробною колонізацією амніотичної порожнини та плодових оболонок, догма про стерильне внутрішньоутробне середовище під час нормальної вагітності виникла досить нещодавно. За допомогою метагеномного секвенування було виявлено великийплацентарний мікробіом, наявність мікроорганізмів у амніотичній порожнині у жінок в нормальних термінах вагітності. Також було виявлено у малюків, що були народжені шляхом кесарського розтину, наявність мікроорганізмів у тканинах кишечника, що отримані з операційної під час резекції аномалій кишечника одразу після народження та до початку годування. В цьому літературному огляді ми досліджуємо сучасне розуміння мікробної колонізації кишечника дітей та становлення функції шлунково-кишкового тракту. Обговорюємо, як генітальна та екстрагенітальна патології матері, її харчування, спосіб життя, прийом лікарських препаратів під час вагітності формують мікробіом плода і його подальший розвиток у періоді новонародженості. Також не менш важливими для формування мікробіому новонароджених є гестаційний вік, спосіб народження, прийом лікарських речовин включаючи антибіотики та спосіб вигодовування. Тому, на нашу думку, порівняння флори дитини, яка народилась доношеною, у вагінальних пологах та дитини, яка була недоношеною,народженою за допомогою кесарського розтину є клінічно значимим для лікарів різних галузей. Дослідження змін у мікробному складі кишечника є важливим кроком у діагностиці патологічних станів у даному періоді та в розвитку дитини протягом всього життя.The neonatal period is critical in the development of the microbiome and the gastrointestinal tract. That is, the microbiome regulates not only the processes that are associated with the basic functions of the gastrointestinal tract, but is associated with the content of vitamins and micronutrients, affects the development of the nervous and endocrine systems of newborns.

Fortunately, microbiome and immunity of pregnant get ready the infant for his inevitable complications. Although preterm birth has been connected with bacterial colonization of the amniotic cavity for many years, the dogma of a sterile intrauterine environment during a normal pregnancy has appeared only recently. Numerous placental microbiome and the occurrence of microorganisms in the amniotic cavity in normal pregnancy was demonstrated by metagenomic sequencing. The occurrence of microorganisms in intestine got from the operating room during resection of intestinal abnormalities immediately after birth and before feeding was also found in neonates born by caesarean section.

In this literature review, we explore the update understanding of microbial colonization of the intestine and foundation of function of the gastrointestinal tract. We discuss how mother’s genital and extragenital pathologies, her diet, lifestyle, taking drugs during pregnancy form the microbiome of the fetus and its further development in the neonatal period. Also, equally important for the establishment of the neonatal microbiome are gestational age, mode of delivery, type of feeding and medication, including antibiotics. Therefore, in our opinion, the comparison of microbiota of a full-term newborn in vaginal birth and an infant born prematurely or by cesarean section is clinically significant for physicians in various fields. The study of changes in the microbial composition of the intestine is an important step in the diagnosis of pathological conditions in this period.